| 韦雅芹,夏世金,陈塑宇,邰先桃.低氧性大鼠肺动脉平滑肌细胞tsRNA的表达谱分析[J].老年医学与保健,2023,29(1):128-131,144 |
| 低氧性大鼠肺动脉平滑肌细胞tsRNA的表达谱分析 |
| Analysis of expression profile of tsRNA in pulmonary artery smooth muscle cells of hypoxic rats |
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| DOI：10.3969/j.issn.1008-8296.2023.01.028 |
| 中文关键词: 肺动脉平滑肌细胞 大鼠 tRNA衍生的小RNA 转运RNA 非编码RNA 低氧性肺动脉高压 |
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| 中文摘要: |
| 目的 观察低氧性大鼠肺动脉平滑肌细胞(rat pulmonary artery smooth muscle cells,RPASMCs)中1类新型非编码RNA-tRNA衍生的小RNA(tRNA-derived small RNA,tsRNA)表达情况.方法 采用1％O2的低氧培养箱和常氧培养箱分别培养RPASMCs 24 h,通过tsRNA高通量测序技术和生物信息学检测并分析RPASMCs中tsRNA的表达差异.结果 tsRNA高通量测序检测到3806个tsRNA,其中具有明确类型的有504个(上调的tsRNA有195个,下调的tsRNA有309个),差异表达的上调和下调的tsRNA分别为116个和156个,在进一步剔除掉片段长度<16 nt的tsRNA之后,与常氧培养比较,低氧处理的RPASMCs表达显著上调的tsRNA有59个(P<0.01),表达显著下调的tsRNA有9个(P<0.01).结论 低氧刺激RPASMC后,tsRNA表达存在明显差异,可能影响PASMC增殖、凋亡和迁移等功能,可为深入阐明低氧性肺动脉高压的发生机制提供新方法和新思路. |
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